Jednym ze statutowych celów naszego Towarzystwa, prowadzącego działalność od 1990r., jest ochrona materialna zabytków kolejnictwa jako dóbr narodowych. Możemy się pochwalić szeregiem sukcesów w tej dziedzinie, m.in. odrestaurowaniem sześciu zabytkowych wagonów, które są obecnie eksponowane w Skansenie PKP Parowozownia Kościerzyna. Między innymi dzięki naciskom PTMKŻ utworzono Skansen Parowozownia Kościerzyna. Największym naszym sukcesem jest skompletowanie i odrestaurowanie jednostki elektrycznej eksploatowanej do lat siedemdziesiątych na trójmiejskiej Szybkiej Kolei Miejskiej. Działania Towarzystwa doprowadziły również do zabezpieczenia blisko 50 zabytkowych pojazdów kolejowych przed fizyczną likwidacją oraz przekazania ich pod nadzór Skansenu w Kościerzynie. W działaniach tych współpracujemy z wieloma organizacjami z Polski i z zagranicy, Skansenem PKP Parowozownia Kościerzyna oraz Służbą ochrony zabytków.
W chwili obecnej Towarzystwo jest posiadaczem 13 zabytkowych wagonów podarowanych przez między innymi takie firmy jak Stocznia Gdańska, Naftobazy z o.o. i Kolejowe Zakłady Automatyki Zielonka PP. Ostatni zabytkowy wagon Towarzystwo otrzymało w 1999 r. Dwa z nich eksponowane są w Skansenie w Kościerzynie reszta czeka na odrestaurowanie.
Zajmujemy się także propagowaniem transportu kolejowego w aspekcie turystycznym. W działalności tej często współpracujemy z innymi organizacjami społecznymi i turystycznymi z kraju i zagranicy. Organizujemy pociągi specjalne dla miłośników kolei głównie po historycznych zamkniętych już liniach. W 2000 r. zorganizowaliśmy sześć takich przejazdów. W 2001 roku udało się nam zorganizować cztery przejazdy w tym jeden siedmiodniowy dla miłośników z Niemiec. W 2002 r. zorganizowaliśmy trzy przejazdy w tym jeden czterodniowy po Kaszubach.
Uczestniczyliśmy w konferencjach poświęconych ochronie zabytków techniki. Na ostatniej tego typu konferencji zorganizowanej przez Politechnikę Gdańską w 1999r. przedstawialiśmy projekt utworzenia w Gdańsku Muzeum Transportu na bazie bankrutujących ZNTK.

We wrześniu 2000 r wraz ze Starostwem w Nowym Dworze Gdańskim, Gminami Stegna i Sztutowo podjęliśmy działania na rzecz reaktywowania Żuławskiej Kolei Dojazdowej.
15 sierpnia 2002 r. dla turystów i mieszkańców powiatu nowodworskiego zorganizowaliśmy pierwszy po sześciu latach przejazd pociągiem na Żuławskiej Kolei Dojazdowej.
W 2002 r. dzięki dotacji z Urzędu Marszałkowskiego Województwa Pomorskiego odnowiliśmy i uzupełniliśmy znaki z nazwami stacji na Żuławskiej Kolei Dojazdowej.
Baza kolei została zorganizowana w Nowym Dworze Gdańskim w istniejącej lokomotywowni. 17 września 2001 r. Starostwo Powiatowe w Nowym Dworze Gdańskim przekazało w bezpłatne użytkowanie Pomorskiemu Towarzystwu Miłośników Kolei Żelaznych część dzierżawionej już od PKP linii kolejowej.
Na początku 2003 r. Starostwo Nowodworskie przekazało w użyczenie Naszemu Towarzystwu cały tabor będący już Jego własnością. Na podstawie tej umowy towarzystwo stało się operatorem na Żuławskiej Kolei Dojazdowej.

Dnia 21 czerwca 2003 ruszyły pierwsze planowe pociągi na Żuławskiej Kolei Dojazdowej. Obecnie uruchamiamy cztery pary pociągów na dobę; 1 parę w relacji Nowy Dwór Gdański - Prawy Brzeg Wisły oraz 3 pary Prawy Brzeg Wisły - Sztutowo. Równocześnie sukcesywnie trawają remonty lokomotyw, dzięki którym już niedługo będziemy posiadali 100% sprawnych lokomotyw.

Towarzystwo uzyskuje fundusze głównie z następujących źródeł:
1. Składki członkowskie.
2. Darowizny.
3. Przychody z organizowanych pociągów specjalnych.
4. Dotacje.